Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim55G3X8Y1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim55G3X8Y1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms