Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r167G3UW71 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms