Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms