Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Farp1F8VPU2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms