Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5160F8VPN3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5160F8VPN3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms