Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm5624F6ZZG8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm5624F6ZZG8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms