Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rarres1F6ZIS7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms