Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8220F6YKI2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms