Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm8444F6XS56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms