Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Crocc2F6XLV1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms