Protein–RNA interactions for Protein: F6W8I0

Yjefn3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yjefn3F6W8I0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Yjefn3F6W8I0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms