Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp946F6VWU8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp946F6VWU8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp946F6VWU8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp946F6VWU8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp946F6VWU8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zfp946F6VWU8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp946F6VWU8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms