Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn5F6UCX4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms