Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prl3d2F6R3P9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prl3d2F6R3P9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms