Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms