Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc146E9Q9F7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms