Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdhr2E9Q7P9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdhr2E9Q7P9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms