Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms