Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r48E9Q5D8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r48E9Q5D8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms