Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde8bE9Q4S1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde8bE9Q4S1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms