Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms