Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NbasE9Q411 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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NbasE9Q411 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NbasE9Q411 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NbasE9Q411 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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NbasE9Q411 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NbasE9Q411 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NbasE9Q411 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms