Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Y8

Gm6811, Predicted gene 6811, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6811E9Q3Y8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm6811E9Q3Y8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm6811E9Q3Y8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms