Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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