Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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Zfp558E9Q1J0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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