Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms