Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc1E9Q043 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms