Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddx60E9PZQ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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