Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms