Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms