Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30dE9PWL0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30dE9PWL0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms