Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc17E9PVB5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms