Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Gcn1E9PVA8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gcn1E9PVA8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gcn1E9PVA8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Gcn1E9PVA8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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