Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgaE9PV24 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms