Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm43720E0CXM8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm43720E0CXM8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm43720E0CXM8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm43720E0CXM8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm43720E0CXM8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm43720E0CXM8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm43720E0CXM8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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