Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms