Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms