Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms