Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3543D3Z235 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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