Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm7849D3YX03 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm7849D3YX03 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm7849D3YX03 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm7849D3YX03 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm7849D3YX03 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms