Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Gm20547B8JJN0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Gm20547B8JJN0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm20547B8JJN0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm20547B8JJN0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm20547B8JJN0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm20547B8JJN0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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