Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms