Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc11B2RXC1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms