Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms