Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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