Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms