Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc2B2RR83 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms