Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms