Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf25B1AWN9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms