Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13178B1AVU7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms